MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM02

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013519	ATA	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013519	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013519	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013519	AAT	2	6	495	500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013519	A	7	7	510	516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013519	T	7	7	535	541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013519	ATA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013519	TAAT	2	8	571	578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013519	GGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013519	ATTAT	2	10	619	628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013519	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013519	AGG	2	6	690	695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013519	TTGA	2	8	1064	1071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013519	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013519	TGA	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013519	AG	3	6	1625	1630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013519	TAC	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013519	AT	3	6	2029	2034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013519	T	6	6	2161	2166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013519	ATA	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013519	TTG	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013519	TGT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013519	C	7	7	2410	2416	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_013519	TTA	2	6	2427	2432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013519	T	6	6	2450	2455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013519	CTA	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013519	AT	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013519	T	6	6	2682	2687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013519	A	6	6	2688	2693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013519	T	7	7	2725	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013519	TTTA	2	8	2768	2775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013519	TTATA	2	10	2782	2791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013519	AAT	3	9	2869	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013519	TAT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013519	T	6	6	2914	2919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013519	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013519	ATA	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013519	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013519	TA	3	6	3023	3028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013519	T	6	6	3040	3045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013519	CCT	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013519	GTC	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013519	TCAG	2	8	4664	4671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013519	TAT	2	6	4791	4796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013519	GA	3	6	4865	4870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013519	T	6	6	6635	6640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013519	AAT	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013519	T	8	8	6705	6712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013519	AGT	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013519	T	7	7	6725	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013519	A	6	6	6745	6750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013519	AAT	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013519	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013519	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013519	TTTA	2	8	6905	6912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013519	A	6	6	6919	6924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013519	AT	3	6	6942	6947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013519	ATTAA	2	10	7020	7029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013519	A	6	6	9076	9081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013519	TAA	2	6	9127	9132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013519	AATA	2	8	9133	9140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013519	T	6	6	9150	9155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013519	AAT	2	6	9723	9728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013519	AT	3	6	10634	10639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013519	CGT	2	6	10657	10662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013519	ACG	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013519	ATA	2	6	10700	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013519	CCT	2	6	10956	10961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013519	ATTT	2	8	10966	10973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013519	TAT	2	6	10975	10980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013519	A	7	7	10986	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013519	TAT	2	6	11007	11012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013519	A	6	6	11065	11070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013519	AG	3	6	11132	11137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013519	ATTT	2	8	11327	11334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013519	TTA	2	6	11335	11340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013519	AGT	2	6	11352	11357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013519	A	6	6	11417	11422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013519	ATTT	2	8	11431	11438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013519	GT	4	8	11474	11481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013519	T	6	6	12112	12117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013519	ACAAA	2	10	12200	12209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013519	A	6	6	12237	12242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013519	AAT	2	6	12296	12301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013519	ACCA	2	8	12307	12314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013519	GATT	2	8	12345	12352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013519	ACCA	2	8	12358	12365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013519	A	6	6	12384	12389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013519	ATAA	2	8	12422	12429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013519	TA	4	8	12465	12472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013519	AAC	2	6	12501	12506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013519	ACCG	2	8	12522	12529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013519	TTTA	2	8	12540	12547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013519	TAA	2	6	12548	12553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013519	AT	3	6	12559	12564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013519	ACCA	2	8	12579	12586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013519	ACCA	2	8	12591	12598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013519	AAAC	2	8	12622	12629	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013519	T	7	7	12667	12673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013519	A	7	7	12723	12729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013519	TAGA	2	8	12756	12763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013519	TA	3	6	12764	12769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013519	CAA	2	6	12777	12782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013519	GAAC	2	8	12824	12831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013519	A	7	7	12834	12840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013519	AATGC	2	10	12873	12882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013519	TA	3	6	12910	12915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013519	AAG	2	6	12918	12923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013519	TAT	2	6	12937	12942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013519	A	8	8	12984	12991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013519	AACTT	2	10	13013	13022	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013519	ATA	2	6	13033	13038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013519	AT	3	6	13130	13135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013519	AG	3	6	13160	13165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013519	A	6	6	13211	13216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013519	T	7	7	13233	13239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013519	GAA	2	6	13288	13293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013519	GGAAAG	2	12	13307	13318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013519	ATT	2	6	13620	13625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013519	AT	3	6	13638	13643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.